主角设定类似质量效应的女性谢菲尔德，在一个星球上发现了"星核"，一个星球的能量结晶这样的东西，不知为何，星核融入了主角，主角突破外星人阻拦回到地球。
而外星人不愿意让自己星球的星核落入他人手中，便派遣了大批军队，异星生物攻打地球。而主角便用被星核增强了的能力与外星人作战。
大战持续了一段时间，最终决战是与对方同样被星核增强能力的指挥官，两人势均力敌，最后，敌方指挥官受了致命伤，而主角断了一只手臂，濒临死亡，地球也由于这场大战变得千疮百孔。
两人临死前互相注视，仿佛有无限的话语，这时，地球的星核出现，融入了主角的身体。主角便因此能够脱离肉体束缚，变为能量体。主角面前出现选项，是要回到过去，清除世间的恶，或是回到过去，增强世间的善。
主角她…选择了先存档(用无尽的能量保存了宇宙状态)，然后选择了清除恶。结果，整个宇宙一片死寂，主角便恢复存档，选择了增强善。
做出了这一选项后，主角保持能量体的身份，重新经历过去。时间闪到至高中，场景是主角所处的生存游戏部(场景，人员都是芳文社百合作品的风格)。
主角与社团好友喝茶闲聊(似乎友人们都知道主角不再属于人类了)的过程中，聊到了因病身亡的好友兼社团创始人，一名充满阳光的少女。
少女常年患病，身体状况不好，却想成立沙滩排球社，而社团其他人也想要支持她的想法，找学校商谈，但学校以没有沙滩(笑)为理由拒绝了社团申请。
少女说着"没办法呢"，便递交了生存游戏部的成立申请。而学校也同意了，并为社团提供了活动场所。但好景不长，少女身体状况每况愈下，不久便离开了人世。其他人为了少女的心意，将社团活动继续了下去。
闲聊中，她们感慨少女未能亲身经历社团活动。于是，主角便用能量，唤起了少女的灵体。主角与少女一组，对抗社团其余人。(虽然基本都是主角发挥，因为有实际的战斗经验)
一场游戏后，少女与社团成员闲聊了一会，并感谢她们让自己体验到社团活动，就渐渐地消失了。
主角转过身，高中场景不见了，主角与外星指挥官面对面浮在宇宙中。两人相视而笑，外星指挥官挥挥手，也渐渐消失了。主角做出了选择，自己彻底化为能量成为意志体，守护整个宇宙的过去，现在以及未来。